MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI04

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021504	AG	3	6	1985	1990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021504	TAT	2	6	2179	2184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021504	TAT	2	6	2206	2211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021504	AAT	2	6	2212	2217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021504	A	6	6	2222	2227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021504	T	6	6	3338	3343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021504	AAT	2	6	3392	3397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021504	TAT	2	6	3409	3414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021504	TGT	2	6	3464	3469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021504	TAT	2	6	3486	3491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021504	T	7	7	3503	3509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021504	T	7	7	3539	3545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021504	A	7	7	6331	6337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021504	CTTGT	2	10	6366	6375	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_021504	AAAG	2	8	6382	6389	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021504	TGG	2	6	6398	6403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021504	TCT	2	6	6421	6426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021504	CA	3	6	6474	6479	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021504	A	6	6	6482	6487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021504	TTA	2	6	6515	6520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021504	AT	4	8	6574	6581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021504	AAT	2	6	6591	6596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021504	A	6	6	6607	6612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021504	GATT	2	8	6614	6621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021504	GAA	2	6	6627	6632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021504	AGG	2	6	6676	6681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021504	CAGT	2	8	7369	7376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021504	TAC	2	6	7413	7418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021504	TTA	2	6	7436	7441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021504	TAA	2	6	7448	7453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021504	TAT	2	6	7566	7571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021504	TCC	2	6	7581	7586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_021504	AT	3	6	7588	7593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021504	AAC	2	6	7594	7599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021504	TAA	2	6	7659	7664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021504	TA	4	8	7734	7741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021504	AGGTT	2	10	8396	8405	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021504	T	6	6	8474	8479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021504	TG	3	6	8485	8490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021504	AGAA	2	8	9158	9165	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021504	TTG	2	6	9574	9579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021504	T	6	6	9624	9629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021504	TTA	2	6	9702	9707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021504	CGAC	2	8	9738	9745	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021504	TTA	2	6	9807	9812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021504	ATG	2	6	9827	9832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021504	TGA	2	6	9854	9859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021504	CT	3	6	12072	12077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021504	CTGT	2	8	12089	12096	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021504	GGTT	2	8	12273	12280	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021504	CAT	2	6	12329	12334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021504	ATT	2	6	12761	12766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021504	TTA	2	6	12767	12772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021504	ATC	2	6	12781	12786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021504	TA	3	6	12826	12831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021504	TA	4	8	12834	12841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021504	AT	4	8	12843	12850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021504	TA	3	6	12852	12857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021504	AT	4	8	12859	12866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021504	ATA	2	6	12896	12901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021504	AGG	2	6	12917	12922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021504	TTA	2	6	14092	14097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021504	CTG	2	6	14139	14144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021504	TAA	3	9	14173	14181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021504	T	6	6	14192	14197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021504	CTT	2	6	14204	14209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021504	CAA	2	6	14219	14224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021504	AAT	2	6	14242	14247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021504	GAA	2	6	14255	14260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021504	CCT	2	6	14261	14266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_021504	GT	3	6	14281	14286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021504	ATT	2	6	14311	14316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021504	CGG	2	6	14404	14409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021504	T	6	6	14429	14434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021504	TATT	2	8	14492	14499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021504	T	6	6	14506	14511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021504	TTA	2	6	14616	14621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021504	T	6	6	14652	14657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021504	AAGC	2	8	15742	15749	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_021504	ATAG	2	8	15761	15768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021504	CACTA	2	10	15777	15786	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_021504	CGG	2	6	15860	15865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021504	TCCC	2	8	15868	15875	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_021504	TA	3	6	15882	15887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021504	TTTC	2	8	15888	15895	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021504	ACA	2	6	15930	15935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021504	CCAA	2	8	15964	15971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021504	GCA	2	6	15977	15982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021504	GAA	2	6	16039	16044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021504	ATA	2	6	16086	16091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021504	A	6	6	16113	16118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021504	TAAA	2	8	16137	16144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021504	T	6	6	16202	16207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021504	ATC	2	6	16309	16314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021504	CTG	2	6	16336	16341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021504	GGA	2	6	16372	16377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.